Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms