Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms