Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms