Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERFP50548 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERFP50548 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERFP50548 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms