Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms