Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCAPD3P42695 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCAPD3P42695 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms