Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms