Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms