Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms