Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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HOXA13P31271 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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HOXA13P31271 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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HOXA13P31271 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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HOXA13P31271 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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