Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5AP29375 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms