Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RXRBP28702 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRBP28702 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRBP28702 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRBP28702 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms