Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms