Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms