Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA3P25788 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms