Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSSP25774 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms