Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YY1P25490 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YY1P25490 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YY1P25490 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YY1P25490 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YY1P25490 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YY1P25490 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YY1P25490 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YY1P25490 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YY1P25490 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YY1P25490 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms