Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNCP24821 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNCP24821 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNCP24821 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms