Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms