Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms