Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPGDP15428 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPGDP15428 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPGDP15428 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPGDP15428 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPGDP15428 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPGDP15428 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms