Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms