Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD1P0DJD0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms