Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM200BP0CF97 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms