Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms