Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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