Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms