Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms