Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTN1O94822 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTN1O94822 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTN1O94822 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTN1O94822 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTN1O94822 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTN1O94822 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms