Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms