Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms