Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms