Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEPDC5O75140 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEPDC5O75140 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms