Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMFO60524 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEMFO60524 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEMFO60524 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEMFO60524 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms