Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms