Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN1O60240 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN1O60240 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms