Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRXO43186 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRXO43186 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CRXO43186 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRXO43186 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms