Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNMO15061 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNMO15061 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNMO15061 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNMO15061 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNMO15061 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNMO15061 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNMO15061 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms