Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms