Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KR12 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KR12 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KR12 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KR12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms