Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms