Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms