Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms