Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms