Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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