Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TTC9Q92623 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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TTC9Q92623 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TTC9Q92623 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTC9Q92623 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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