Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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