Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms