Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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