Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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